營利事業如有商品或原料、物料、在製品等因過期、變質、破損或因呆滯無法出售，依營利事業所得稅查核準則第101條之1規定，除了可依會計師查核簽證報告或年度所得稅查核簽證報告之外，應於事實發生後30日內檢具清單向該管稽徵機關申請商品或原料報廢相關事宜。

營利事業之報廢損失金額如在500萬元以下且稽徵機關認為符合書面審查案件者，可檢具下列證明文件（如係影本請加蓋公司及負責人章並加註「與正本相符」字樣），由稽徵機關核實認定報廢損失：

一、營利事業原物料、商品變質報廢或災害申請書。
二、毀棄過程前、中、後照片（皆須能看出報廢物品之品名及數量，照片應有日期）。
三、有關銷毀處理運棄之過磅單、支付費用及殘值變賣收入憑證（請註明處理或變賣品名、數量及單價）。 

有關商品、原物料及在製品報廢之報備申請，營業事業除可採書面申請外，也可利用網路申請：自財政部稅務入口網站→點選「線上申辦」→點選「稅務線上申辦」→選擇「營所稅」頁箋→點選「15.申請固定資產、設備、原物料及商品報廢之報備」，填寫電子表單後傳送。