合於所得稅法第4條第1項第13款規定之教育、文化、公益、慈善機關或團體及其作業組織，應依同法第71條規定辦理結算申報；其不合免稅要件者，仍應依法課稅。又前開機關團體其用於與其創設目的有關活動之支出，雖低於基金之每年孳息及其他各項收入70%，不合免稅要件，但經主管機關查明函請財政部同意者，不在此限，為教育文化公益慈善機關或團體免納所得稅適用標準(以下簡稱免納所得稅適用標準)第2條第1項第8款所明定。
　 　　舉例說明，甲慈善團體96年度列報餘絀數114萬餘元，並以其符合免納所得稅適用標準免納所得稅，列報課稅所得額0元。經查核發現甲慈善團體用於創設目的有關活動之支出為101萬餘元，未達該年孳息及其他經常性收入計216萬餘元之70%，未符合前揭免納所得稅適用標準第2條第1項第8款規定，乃核定餘絀數及課稅所得額。甲慈善團體復查主張已向主管機關辦理盈餘保留供後續年度使用，依法應免納所得稅，惟迄未能提供前開同意證明文件供核，致不符首揭免納所得稅適用標準規定，仍維持原核定。